Y tipli molekulyar sieves almaza bənzər yaxın altıbucaqlı bir quruluşa malikdir. Beta qəfəsi, almazın karbon atom qovşaqlarını əvəz etmək üçün struktur vahid kimi istifadə olunursa, yəni beş beta qəfəsinin altıbucaqlı sütunlu qəfəsləri ilə bir-birinə bağlıdır və qalan dörd beta qəfəs, bir oketaedral zeolit kristalının ucunda yerləşir quruluş meydana gəlir. Bu quruluşla əlaqələndirməyə davam edərək, y tipli molekulyar ələk quruluşu əldə edilir. Bu quruluşda, β qəfəs və altıbucaqlı sütunlu qəfəsin qurulduğu böyük qəfəs, səkkiz tərəfli zeolit qəfəsdir və onların əlaqəli pəncərə dəlikləri, orta effektiv məsaməli ölçüsü, y-tipli molekulyar ələklərin məsaməli ölçüsü olan on iki ikili üzükdür. X tipli molekulyar ələk və y tipli molekulyar ələk quruluşu tam olaraq eynidir, lakin y tipli molekulyar ələk siliksiz alüminium nisbəti yüksəkdir, hidrotermal sabitlik güclüdür, buna görə daha geniş istifadə olunur.
